Pessoal, eu acho que mais importante que separar a categoria em "aceleração 3D ou não", "Ubuntu ou Kubuntu", "Gnome ou KDE", mais importante seria separar em "cubo" ou "sem cubo". Claro, porque é quase impossível comparar uma área de trabalho plana com uma "encubada". É até uma questão de gosto pessoal, aquele cubo ou a gente ama ou a gente odeia (eu, por exemplo, não suporto!). E também porque é perfeitamente possível ter um dock e outros efeitos sem aceleração 3D. Mas não é possível ter específicamente o cubo do Compiz sem espetar no mínimo uma GeForce 4 no AGP.
A minha opinião é que deve-se criar sim a divisão entre com/sem aceleração 3D. Mas uma divisão com/sem Compiz é muito simplista, porque uma área de trabalho com o cubo é algo totalmente diferente de uma área plana, mesmo que se use um dock cheio de efeitos ou aquelas janelas "gelatinosas". Eu sei que é divisão demais, mas acho que dentro da categoria "com aceleração 3D" os desktops com e sem o cubo devem ser avaliados separadamente.