Amigo,
vc esta certo, tera que configurar alguma coisa nos programas para que os mesmos venham a atender suas necessidades.
Mais para iniciar usando simplesmente, faça a instalação dos mesmos com o apt-get (synaptic) que após todo processo for concluído os programas ja estarão funcionais e aptos a serem executados.
Ae estando tudo instalado e funcionando vc pode pesquisar mais detalhadamente apenas o que vc precisa a nivel de ajustar as configurações a sua necessidade e lógico, postar suas dúvidas mais especificas aqui que sempre haverá alguem para ajudar.
Aconselho vc utilizar o webmin que é uma aplicações web (acessa via browser
http://127.0.0.1:10000) que vc usa entre outras tantas para gerenciar estes programas. Para criar e gerenciar as bases de dados no mysql instala também o pacote phpmyadmin, que tbem é um aplicativo web. (estes dois vc tbem instala com APT).
Arlei