também sou novato e tive a mesma dúvida, depois de pesquisar muito cheguei a conclusão q os filesystems são próximos. em características, onde um e melhor o outro é um pouco pior mas compensa em outra coisa. e em tempo a diferença e sempre de alguns segundos ou menos em operações massivas q vc nunca vai fazer ou pelo menos não todo dia.
no final das contas fiquei com ext3 q é padrão do ubuntu, assim nao viro exerção. ou seja, o q foi feito para funcionar no ubuntu deve funcionar no ext3 assim evito perder tempo procurando como fazer programa A ou B rodar em outro sistema de arquivos. Acredito q este tempo seria muito maior q a soma dos décimos de segundos economizados por outro ext3( q não vai nada mal nas comparações)