Olá Carlos,
Sou novo no linux sim. Consegui instalar, substituindo o 777 por +x no primeiro comando. No entanto o programa não roda, acho que esta faltando alguma biblioteca java ou algo assim. Estou pesquisando nas páginas do gvSIG. Sempre que instalo um programa no linux procuro colocar no opt. Quando a instalação se da em pagotes ele (o programa cria diretório e se auto instala onde foi anteriormente configurado, não é isso?). Faço isso para, no caso de haver necessidade de desisntalação saber onde realmente coloquei. Mas ainda tenho que aprender muito, e quanto a instalação de programas em java sei muito pouco. Mas devagar eu chego lá, principalmente porque as comunidades linux são maravilhosas, com pessoas que dispoẽm do seu tempo e conhecimento para ajudar a outros que nem conhecem. Acho que isso é uma das coisas que mais me facinam no mundo linux.
Saudações,
kdbin