Faça o seguinte:
1. Mova o conteúdo de ~/.thunderbird/XXXXXXX.default/Mail/[conta que quer importar] para uma pasta ~/.thunderbird/mensagens/[conta importada]
2. Crie uma nova conta na máquina que receberá as informações manualmente. Ficará com os dados em branco.
3. Na nova conta, botão direito, "propriedades", "servidor", "Pasta Local" e escolha ~/.thunderbird/mensagens/[conta importada]
4. Reinicie o Thunderbird.