Só para constar , no final das contas o problema não era com a proteção de tela , na verdade deu a impressão de ter resolvido quando eu desactivei a mesma , mas depois o problema voltou , porém consegui "resolve-lo" , coloco entre aspas porque não foi exactamente uma solução , o que eu fiz (depois de checar o som como disse o xterminator)
foi instalar o fluxbox e testar , para minha surpresa o problema acabou quando troquei de ambiente gráfico. Acredito eu
que o motivo das pausas, ou melhor, travamentos momentâneos tenha algo relacionado com o(s) deamond(s) de configurações do gnome , mas apenas acho ,pois desconheço o modo de trabalho dos mesmos.
No final acabou tudo bem , eu sigo usando o que eu gosto do gnome (gnome-panel e nautilus ) , instalei o
LXDE (openbox , pcmanfm ,etc) e ficou tudo normal. ^^