E ai amigo tudo bem.
O que você pode fazer é ir nas propriedades do arquivo e tentar alterar a propriedade para escrita e tentar formatar,também pode usar o comando sudo chmod 777 /local onde está montado o dispositivo e depois tentar formata-lo,foi o que eu fiz no Ubuntu 9.10,para eu só consegui fazer procedimentos quando eu loguei como root no sistema,usando o comando sudo passwd e colocando 2 vezes uma nova senha Unix,ai reiniciei o pc e consegui formatar.
Não sei se vai te ajudar,mas pelo menos vale a tentativa né!