Esqueça o wine, o jdownloader funciona direto no ubuntu, mas como o Falco90 falou tem que ter o java instalado.
Veja um tutorial multimidia
http://www.linuxparatodos.com.br/artigos/tutorial-multimedia-ubuntu-lucid-lynx-10-04Depois instale o jdownloader direto no ubuntu, não pelo wine.
Como falei instale aquele complemento que vai facilitar os comandos direto em pastas.
Baixe o pacote zip do jdownloader, baxei o arquivo sh descompacte o zip, deixe o sh dentro da pasta descompactada.
Vamos supor que vc tenha extraido dentro da home, então ficou uma pasta chamada JDownloader e dentro esta o arquivo sh.
Pelo terminal vc tem que fazer assim.
cd JDownloader (de um enter)
Ficara assim ":~/JDownloader$ "
Vc estara dentro da pasta do JDownloader ai aplica o comando "chmod +x jd.sh"
Depois execute "./jd.sh" sem aspas.
Ele será instalado como na pagina que indiquei depois cria o lançador para ele e pronto.
Com a extensão que indiquei, vc não precisa digitar "cd" para ir buscando as pastas, dentro da pasta onde estaria o jd.sh com o botão direito do mouse teria uma opção "abrir um terminal"
Não queira misturar programas windows com do ubuntu que vc vai se confundir, existe sempre similares ou até mesmo programas que tem no windows próprio para linux, só que nem sempre é deb como vc mesmo falou, mas não é tão dificil como parece.
Tenta ai e qualquer coisa retorna.
Abraço.
quando executo os comandos que vc falou acontece isso como resposta.
e não muda nada.
~$ sudo add-apt-repository ppa:jd-team/jdownloader
Executing: gpg --ignore-time-conflict --no-options --no-default-keyring --secret-keyring /etc/apt/secring.gpg --trustdb-name /etc/apt/trustdb.gpg --keyring /etc/apt/trusted.gpg --primary-keyring /etc/apt/trusted.gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv B305FC46C55F531512AFA579D6B6DB186A68F637
gpg: requisitando chave 6A68F637 de servidor hkp - keyserver.ubuntu.com
gpg: chave 6A68F637: "Launchpad JDownloader PPA"
gpg: Número total processado: 1
gpg: não modificados: 1
~$ sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-wine/ppa
Executing: gpg --ignore-time-conflict --no-options --no-default-keyring --secret-keyring /etc/apt/secring.gpg --trustdb-name /etc/apt/trustdb.gpg --keyring /etc/apt/trusted.gpg --primary-keyring /etc/apt/trusted.gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv 883E8688397576B6C509DF495A9A06AEF9CB8DB0
gpg: requisitando chave F9CB8DB0 de servidor hkp - keyserver.ubuntu.com
gpg: chave F9CB8DB0: chave pública "Launchpad PPA for Ubuntu Wine Team" importada
gpg: Número total processado: 1
gpg: importados: 1 (RSA: 1)
~$ sudo apt-get install -y wine1.3 wine1.3-gecko wine1.3-dbg wine1.3-dev winetricks wisotool gnome-exe-thumbnailer ttf-symbol-replacement-wine1.3
Lendo listas de pacotes... Pronto
Construindo árvore de dependências
Lendo informação de estado... Pronto
E: Impossível achar pacote wine1.3