Oi tatao,
Segundo essa imagem postada a partição Linux ainda está em partição estentida, quando idealmente deveria estar em partição primária.
Já que você está fazendo o 'estrago' total, e que esse hd contém apenas SO, comece excluindo **todas** as partições, ou seja, deixe o disco absolutamente zerado.
Ao fazer as exclusões, reinicie o sistema, porque a gravação realmente só é feita no próximo boot.
A partir daí, entrando novamente pelo Cd-Live, gparted, crie novas partições, colocando a Linux em etx4 na primeira partição primária e, logo a seguir, mais uma para swap.
Pessoalmente não vejo necessidade e tampouco, neste caso, utilidade real de criar uma /home separada.
Feito isso, crie então uma terceira partição, que ainda será primária, em ntfs, para o Windows.
Deixe um espaço não utilizado depois da partição Windows criada para o caso de você querer, futuramente, adicionar partições estendidas para 'brincar' com outros SO.
O Windows deve ser instalado previamente ao Ubuntu, porque ele sobrescreve a área da MBR. Primeiro instala o Windows, depois o Ubuntu.
Não há necessidade, e nem é bom, desabilitar o S.M.A.R.T, que é um útil sistema de verificação de integridade de disco rígido. Ele pode lhe avisar, antecipadamente, de problemas que começam a ocorrer fisicamente na hd.
Uma questão: se você instalar a 10.10 ou ainda a 10.04, instala normalmente em dual-boot?
Esse teste seria adequado para se afastar definitivamente qualquer problema de hardware que pudesse haver.
Os seus HD possivelmente são SATA, então duas coisas a verificar.
1) Alguns modelos de hd ainda possuem jumper para marcação de posição, master ou slave, se for o caso (o que não acredito, mas convém verificar), esse primeiro HD deve estar jumpeado como master;
2) Supondo que o hd seja SATA, mude o cabo para alguma outra porta SATA, de preferência a primeira porta, e se já estiver nesta, mude para a segunda porta.
Adicionalmente, e por último, seria interessante rodar previamente o mentest, para afastar qualquer inconsistência de pente de memória.
[]'s