Pois é, eu estou com o mesmo problema, apesar desse tópico ser bem antigo, aparentemente não há uma solução para ela ainda.
O que eu estou fazendo é o seguinte:
Exportar o proxy pelo terminal:
export http_proxy=http://user:password@ip:porta
export ftp_proxy=http://user:password@ip:porta
Depois abro o programa por esse mesmo terminal em que exportei as variáveis de proxy:
googleearth &
É uma solução meio que alternativa, estou a procura de uma melhor, quando encontrar eu posto ela.
[ ]'s.