Você diz usar o grub do outro linux para carregar o pendrive como se fosse um hd?(gostei da idéia se for isto)
Creio que dê , porém nunca tive essa idéia , coisa de doido!kkkk
Porém creio que vc vai ter que reformatar o pendrive , só fazer a partição / e instalar lá usando a swap do outro , não sei se o particionador pega essa unidade de usb , pois nunca tentei...
Talvez editando a partição e retirando a swap e dando um update no grub dê certo , não vou afirma nada pq nunca tentei essa , porém foi uma boa idéia para quem não tem boot em usb no pc..rs..
Só não pode esquecer e dar boot na entrada sem o usb.
Tenta aeh e posta aqui caso conseguir!
Abração.