Nesse teu caso está meio complicado e esquisito.
Entra com o cd do windows, espera aparecer a tela para instalar o sistema, nessa tela vai ter a opção de instalar e de reparar no caso apertando R.
Faça um teste, na tela preta faça uma reparação do windows, geralmente quando está em ordem vc entra e aparece C:\Windows, e quando está danificado aparece somente C:\
Faça o comando chkdsk /r
Espere o termino, depois faz o fixmbr, eu costumava fazer fixboot e fixmbr
Se não der certo, baixe um hd regenerator e passa para ver se o hd não tem erros, ele é live também, escolhe a opção scan and repair.
Já vi acontecer do cd do windows não achar o sistema, mas isso porque fuçaram na bios e colocaram para reconhecer o hd como sata (AHCI), então o xp não acha mesmo, mas no teu caso ele acha a outra partição, então não seria isso.
Abraço.