Se você não utilizou nenhum comando para apagar o cache do Ubuntu, então você deve ter todos os arquivos baixados em back-up no seu S.O.. Para entender melhor leia
esse site. Se assim for, a depender das necessidades e das possibilidades, você pode copiar esses arquivos para um pen drive ou HD externo e após a atualização instalar tudo novamente.
Eu, pessoalmente, faria diferente. Ao invés de instalar do zero, com formatação e tudo mais, faria o download do CD do
Ubuntu Alternative. Rodaria ele normalmente no Ubuntu instalado no seu computador. Com a janela que irá abrir, mandaria instalar e teria o Ubuntu 12.04 instalado e praticamente não perderia nenhum aplicativo, configuração ou arquivo.
Pensa nisso...