Ola, sou iniciante e estou com esse problema: nautilus versão 3.4.2 iniciando sozinho depois do boot.
Depois de uma tentativa de esvaziar a lixeira e não conseguir, digitei o comando "gksu nautilus" no terminal, digitei a senha e consegui esvaziar a lixeira.
O fato é que depois de ter feito isso, toda vez que reinicio o computador o nautilus inicia tambem (sozinho).
O que devo fazer?
Uso kubuntu12.04.
Faz tempo que não uso uma distro com KDE e portanto pode ser que as coisas tenham mudado desde de então, mas o que acho que pode ter acontecido é que você fechou o seu SO (kubuntu) com o gerenciador de arquivos aberto e aí ele memorizou isso entendendo que toda vez que abrir o SO ele deve abrir o gerenciador de arquivo.
Veja nas configurações do kubuntu algo relativo a isso que nas versões do kde antigas tinha. Tem também uma pasta oculta chamada
autostart ou algo assim também, procure na literatura sobre o kde algo sobre autostrat, pois como não uso não posso ser mais específico de como e onde resolver tal problema agora no kde mais novo.
Uma pergunta se você usa o Kubuntu o gerenciador de arquivos dele seria o dolphi algo assim e não o nautilis que é do gnome, está havendo alguma confusão aí ou vc usa mesmo o nautilus mesmo no kubuntu?