Olá Emmers,
Eu costumo fazer o backup dos servidores para um segundo HD, reservado apenas pra isso. Com o bacula instalado, crio um pool de backup em disco, com vários volumes de backup, em torno de 20 ou 30, entre 1 e 10GB cada [o bacula faz a criação dos volumes conforme sua necessidade].
Não esqueça de dimensionar esse HD de forma a ter um espaço 2 ou 3 vezes maior que a sua quantidade de dados, de forma que você possa manter mais de um backup full, além dos vários backups diferenciais.