Sempre faço atualizações e nunca me deparei com problema nenhum.
No trabalho tenho um P² atualizado do H², passando pelo I², J², K², L², M², N² e O².
O Ubuntu atualiza os pacotes mantidos na distro, desabilita e/ou remove pacotes que são suprimidos da distro e instala os novos pacotes.
Se vc é desconfiado, faça backup da pasta home e mande ver na atualização.