Não entendi direito...
1) vc tinha uma placa de vídeo off board (pci) uma gforce por exemplo e trocou pela ATI Radeon é isso?
ou
2) vc tinha uma onboard e colocou a ATI Radeon?
Bom, de qualquer forma, abre um terminal e digita:
glxgears -printfps
minimiza todos os programas e deixa alguns segundos, vc deve obter uns resultados acima de 3000 para que a placa de video esteja configurada corretamente.
A minha por exemplo:
eduardo@eduardo:~$ glxgears -printfps
5723 frames in 5.0 seconds = 1144.582 FPS
8807 frames in 5.0 seconds = 1761.394 FPS
19544 frames in 5.0 seconds = 3908.669 FPS
19203 frames in 5.0 seconds = 3840.487 FPS
19471 frames in 5.0 seconds = 3894.079 FPS
19599 frames in 5.0 seconds = 3919.772 FPS
19596 frames in 5.0 seconds = 3919.089 FPS
19394 frames in 5.0 seconds = 3878.772 FPS
17036 frames in 5.0 seconds = 3407.082 FPS
Estou usando mtos programas, mas consigo resultados acima de 5000, tenho uma gforce fx 5200 256 mb
mas explica um pouco melhor tua duvida