Amigo,
Quando instalamos o Ubuntu, ele instala automaticamente um gerenciador de boot (no caso é o grub). Esse gerenciador fica na MBR (primeiro cluster de leitura de seu HD), acredito que com o ubuntu instalado não altera e não oferece risco algum no seu winXP, ele irá iniciar normalmente e o DriveClone iniciará fazendo a imagem da sua partição NTFS (partição winXP) normalmente, poi.
Qualquer dúvida poste auqi pra gente.
Um abraço,
LucianoBass