pra resolver isso vc vai ter que editar o xorg.conf(/etc/xorg.conf), será preciso saber as taxas de atualizacao do seu monitor, pra deixar ele com uma resolucao de 1024x768 com taxa de atualizacao de 60Hz insira as seguintes linhas na secao monitor do xorg.conf
HorizSync 31.5 - 50.0
VertRefresh 40-90
Esses valores podem ser alterados, mas para isso voce tera que saber a capacidade do seu monitor.
VLW