Ei, Brayres, você precisa criar um usuário e decidir em qual pasta você irá pôr os arquivos baixados, bem como determinar a qual o disponibilizara para upload.
Você pode fazer tudo isso através de algum menu da ferramenta. Procure, por favor!
O Nicotine possui uma interface pouco intuitiva, imagine você que eu descobrir como conectar a ferramenta a internet por um acaso, o usuário tem que fazer ADVINHAÇÕES em seu menu.